Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
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