Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms