Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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