Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
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