Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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