Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms