Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EXOSC2Q13868 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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