Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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