Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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