Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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