Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN2AQ12879 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
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