Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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RASGEF1BQ0VAM2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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