Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms