Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4BQ07343 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms