Protein–RNA interactions for Protein: Q03052

POU3F1, POU domain, class 3, transcription factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F1Q03052 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms