Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHDQ02161 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHDQ02161 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHDQ02161 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHDQ02161 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHDQ02161 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHDQ02161 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHDQ02161 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHDQ02161 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHDQ02161 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
RHDQ02161 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms