Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms