Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL8P80075 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL8P80075 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms