Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms