Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSX2P58304 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSX2P58304 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSX2P58304 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSX2P58304 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSX2P58304 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSX2P58304 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSX2P58304 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSX2P58304 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSX2P58304 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSX2P58304 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSX2P58304 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSX2P58304 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms