Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA9P57773 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GJA9P57773 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GJA9P57773 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GJA9P57773 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GJA9P57773 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GJA9P57773 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GJA9P57773 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA9P57773 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA9P57773 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms