Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP107P57740 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP107P57740 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP107P57740 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP107P57740 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP107P57740 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP107P57740 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP107P57740 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP107P57740 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP107P57740 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms