Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAV3P56539 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAV3P56539 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAV3P56539 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAV3P56539 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAV3P56539 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAV3P56539 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAV3P56539 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAV3P56539 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAV3P56539 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAV3P56539 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAV3P56539 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAV3P56539 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAV3P56539 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAV3P56539 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAV3P56539 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAV3P56539 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAV3P56539 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAV3P56539 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CAV3P56539 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAV3P56539 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAV3P56539 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAV3P56539 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAV3P56539 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAV3P56539 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms