Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA2D1P54289 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms