Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DNA2P51530 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DNA2P51530 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DNA2P51530 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
DNA2P51530 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DNA2P51530 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DNA2P51530 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DNA2P51530 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DNA2P51530 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DNA2P51530 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DNA2P51530 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNA2P51530 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms