Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLCSP50747 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLCSP50747 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLCSP50747 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms