Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms