Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTPAP49638 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTPAP49638 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTPAP49638 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTPAP49638 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTPAP49638 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTPAP49638 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTPAP49638 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TTPAP49638 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTPAP49638 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTPAP49638 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTPAP49638 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TTPAP49638 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTPAP49638 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTPAP49638 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTPAP49638 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TTPAP49638 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTPAP49638 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTPAP49638 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTPAP49638 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTPAP49638 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TTPAP49638 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TTPAP49638 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TTPAP49638 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TTPAP49638 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TTPAP49638 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TTPAP49638 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TTPAP49638 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TTPAP49638 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TTPAP49638 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TTPAP49638 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTPAP49638 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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