Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRCC3P46736 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms