Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RECQLP46063 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RECQLP46063 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RECQLP46063 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RECQLP46063 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RECQLP46063 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RECQLP46063 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RECQLP46063 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RECQLP46063 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RECQLP46063 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RECQLP46063 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RECQLP46063 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms