Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5CP41229 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms