Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBRP36941 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBRP36941 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBRP36941 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms