Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5C1P36542 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms