Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms