Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms