Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms