Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPC1P35052 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPC1P35052 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPC1P35052 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPC1P35052 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPC1P35052 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPC1P35052 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
GPC1P35052 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPC1P35052 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms