Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPS1P31327 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPS1P31327 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPS1P31327 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPS1P31327 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPS1P31327 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CPS1P31327 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CPS1P31327 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPS1P31327 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPS1P31327 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPS1P31327 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPS1P31327 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPS1P31327 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPS1P31327 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPS1P31327 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPS1P31327 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPS1P31327 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPS1P31327 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPS1P31327 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPS1P31327 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CPS1P31327 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPS1P31327 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPS1P31327 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CPS1P31327 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPS1P31327 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPS1P31327 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPS1P31327 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPS1P31327 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPS1P31327 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPS1P31327 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPS1P31327 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPS1P31327 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPS1P31327 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPS1P31327 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPS1P31327 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPS1P31327 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPS1P31327 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPS1P31327 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPS1P31327 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPS1P31327 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPS1P31327 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPS1P31327 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPS1P31327 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPS1P31327 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPS1P31327 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPS1P31327 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPS1P31327 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPS1P31327 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPS1P31327 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPS1P31327 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPS1P31327 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPS1P31327 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPS1P31327 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CPS1P31327 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPS1P31327 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPS1P31327 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPS1P31327 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPS1P31327 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPS1P31327 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPS1P31327 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CPS1P31327 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPS1P31327 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPS1P31327 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPS1P31327 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPS1P31327 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPS1P31327 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPS1P31327 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPS1P31327 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPS1P31327 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPS1P31327 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPS1P31327 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPS1P31327 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPS1P31327 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPS1P31327 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPS1P31327 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPS1P31327 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPS1P31327 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CPS1P31327 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPS1P31327 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPS1P31327 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPS1P31327 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPS1P31327 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPS1P31327 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPS1P31327 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPS1P31327 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPS1P31327 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CPS1P31327 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPS1P31327 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPS1P31327 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPS1P31327 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPS1P31327 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CPS1P31327 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CPS1P31327 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPS1P31327 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPS1P31327 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPS1P31327 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CPS1P31327 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CPS1P31327 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CPS1P31327 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPS1P31327 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms