Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5DP30049 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms