Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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ARID4AP29374 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID4AP29374 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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