Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD10P28358 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms