Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMBRP28336 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMBRP28336 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMBRP28336 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMBRP28336 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMBRP28336 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMBRP28336 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMBRP28336 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMBRP28336 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMBRP28336 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMBRP28336 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMBRP28336 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMBRP28336 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMBRP28336 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NMBRP28336 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NMBRP28336 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NMBRP28336 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NMBRP28336 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NMBRP28336 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NMBRP28336 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMBRP28336 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMBRP28336 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMBRP28336 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMBRP28336 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMBRP28336 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMBRP28336 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMBRP28336 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMBRP28336 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMBRP28336 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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