Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HMGB2P26583 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms