Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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