Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPI1P17947 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms