Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPB42P16452 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPB42P16452 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPB42P16452 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPB42P16452 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPB42P16452 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EPB42P16452 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPB42P16452 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPB42P16452 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPB42P16452 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPB42P16452 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPB42P16452 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPB42P16452 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPB42P16452 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPB42P16452 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPB42P16452 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPB42P16452 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPB42P16452 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPB42P16452 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPB42P16452 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPB42P16452 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPB42P16452 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPB42P16452 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms