Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL6A2P12110 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms