Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms