Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L1P0DMW3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L1P0DMW3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L1P0DMW3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L1P0DMW3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L1P0DMW3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L1P0DMW3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L1P0DMW3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L1P0DMW3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L1P0DMW3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L1P0DMW3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L1P0DMW3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L1P0DMW3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L1P0DMW3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L1P0DMW3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L1P0DMW3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM10L1P0DMW3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM10L1P0DMW3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM10L1P0DMW3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM10L1P0DMW3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM10L1P0DMW3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM10L1P0DMW3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM10L1P0DMW3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM10L1P0DMW3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM10L1P0DMW3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L1P0DMW3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms