Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBP07199 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPBP07199 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPBP07199 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPBP07199 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPBP07199 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBP07199 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBP07199 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBP07199 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBP07199 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBP07199 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBP07199 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBP07199 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBP07199 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBP07199 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBP07199 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBP07199 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBP07199 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBP07199 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBP07199 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBP07199 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBP07199 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms